I løbet af skoleåret afholder vi ca. én gang om måneden gudstjeneste/messe for alle skolens elever. Nogle af gudstjenesterne er økumeniske (fælleskirkelige), hvor alle skolens elever går samlet til gudstjeneste. Andre er konfessionsdelte; her går katolikkerne til messe i vores egen kirke og resten går til protestantisk gudstjeneste i Esajas Kirke.
Vi gør brug af hele tre kirker:
- Esajas Kirke; vores lokale folkekirke på den anden side af Holmens kirkegård.
- Sankt Ansgar Kirke; den katolske domkirke i Bredgade.
- Vores egen kirke – Sankt Joseph Kirke – på 2. sal i hovedbygningen.
Eleverne er meget engageret i planlægningen og gennemførelsen af gudstjenesterne:
3. klasserne står fast for vores høstgudstjenester
4. klasserne står fast for vores julegudstjenester
5. klasserne står fast for vores påskegudstjenester
6. klasserne står fast for allehelgensgudstjenester.